โรงเรียนกาญจนาภิเษกวิทยาลัย เพชรบูรณ์ ก่อตั้งขึ้นในมหามงคลวโรกาสที่พระบาทสมเด็จพระเจ้าอยู่หัวภูมิพลอดุยเดชฯ ทรงเสด็จเถลิงถวัลยราชสมบัติ ครบ 50 ปี ในวันที่ 9 มิถุนายน 2539 กระทรวงศึกษาธิการ จึงได้จัดตั้ง โรงเรียนเฉลิมพระเกียรติพระบาทสมเด็จพระเจ้าอยู่หัวขึ้น 9 แห่ง ประกาศจัดตั้งเมื่อวันที่ 27 กุมภาพันธ์ 2538 ให้เชื่อครั้งแรกว่า "โรงเรียนเฉลิมพระเกียรติพระบาทสมเด็จพระเจ้าอยู่หัวภูมิพลอดุลยเดชฯทรงครองราชย์ครบ 50 ปี จังหวัดเพชรบูรณ์" ในวโรกาสต่อมาเมื่อวันที่ 28 กุมภาพันธ์ 2538 พระบาทสมเด็จพระเจ้าอยู่หัวภูมิพลอดุลยเดชฯ ทรงพระกรุณาโปรกเกล้าฯ พระราชทานนามโรงเรียนว่า "โรงเรียนกาญจนาภิเษกวิทยาลัย เพชรบูรณ์"

ปัจจุบันโรงเรียนได้จัดตั้งศูนย์เฝ้าระวังทางวัฒนธรรมในสถานศึกษา และมีการแต่งคณะกรรมการจากนักเรียนในโรงเรียน โดยมีครูเป็นที่เป็นปรึกษา