สถาบันเพาะกล้าคุณธรรม เป็นสถานศึกษาอีกรูปแบบหนึ่งซึ่งมีวัตถุประสงค์เพื่อ

๑ พัฒนาเด็กและเยาวชนทั่วประเทศที่ด้อยโอกาส หรืออยู่ในครอบครัวที่ประสบปัญหาทางสังคม ขาดความอบอุ่นและความมั่นคงในการดำรงชีวิตที่มีความพร้อมและความสนใจในมิติด้านคุณธรรม การศึกษาในระดับโรงเรียนและอบรมความรู้และทักษะในการประกอบอาชีพไปพร้อม ๆ กัน เพื่อเป็นต้นกล้าคุณธรรมของสังคมไทยในอนาคตที่ได้รับการพัฒนาทั้งทางร่างกาย จิตใจ และสติปัญญา

๒. เพื่อสร้างระบบกัลยาณมิตรเป็นเครือข่ายคุณธรรมครอบคลุมทั่วประเทศ จากเด็ก เยาวชน/ครอบครัวของเด็กและเยาวชนที่ผ่านกระบวนการเพาะกล้าคุณธรรมร่วมกัน

๓. เพื่อเตรียมความพร้อมให้แก่ครอบครัว ชุมชน วัด และสังคมไทยที่จะได้บุคลากรที่มีคุณภาพและคุณธรรมเป็นทายาทที่สร้างสรรค์สถาบันครอบครัวและชุมชนให้เข้มแข็ง เป็นทายาทที่พร้อมจะสืบทอดศาสนาให้มั่นคงสืบไป