สร้างขึ้นเพื่อเทอดพระเกียรติและน้อมรำลึกถึงพระมหากรุณาธิคุณ ของพระบาทสมเด็จพระปิ่นเกล้าเจ้าอยู่หัว พระอนุชาในพระบาทสมเด็จพระจอมเกล้าเจ้าอยู่หัวรัชกาลที่ ๔ ซึ่งมีพระปรีชาสามารถในด้านวิชาการทหารแบบตะวันตก ทรงพัฒนากองทัพและประเทศชาติ จนก้าวหน้าทัดเทียมอารยประเทศ

โดยพระบาทสมเด็จพระเจ้าอยู่หัวภูมิพลอดุลยเดชเสด็จพระราชดำเนินเปิดศาลเมื่อปี พ.ศ. ๒๕๒๒

ศาลสมเด็จพระปิ่นเกล้าฯ ตั้งอยู่ในบริเวณวัดเขาหินซ้อน ริมทางหลวงหมายเลข ๓๐๔ (ฉะเชิงเทรา-กบินทร์บุรี)กิโลเมตรที่ ๕๓ ห่างจากตัวเมืองฉะเชิงเทรา ๕๓ กิโลเมตร บริเวณโดยรอบศาลเป็นสวนรุกชาติ มีความร่มรื่น และมีประชาชนเข้าไปสักการะบูชาที่ศาลเป็นประจำ