วัดคลองมะเดื่อได้จัดสร้างขึ้น เมื่อวันที่ ๑๗ พฤษภาคม พ.ศ.๒๕๒๒ โดยมี พระครูสาครธีรธรรม (พูนทรัพย์ ธมฺมธีโร) เจ้าอาวาสองค์ปัจจุบัน คิดที่จะสร้างวัดขึ้นมาเพื่อจะรวบรวมสาธุชนให้เป็นปึกแผ่น จึงได้เดินทางหาสถานที่เหมาะสม ในที่สุดมาพบสถานที่แห่งนี้ จึงได้สร้างเป็นวัดขึ้นมา และได้ชื่อวัดว่า “วัดคลองมะเดื่อ” ตามชื่อตำบล และได้รับพระราชทานวิสุงคามสีมาเมื่อวันที่ ๒๗ พฤษภาคม พ.ศ. 2526

ปรับปรุงข้อมูล ครั้งที่ ๑

วัดคลองมะเดื่อ ตั้งอยู่เลขที่ ๗๐ บ้านคลองตาหลง ถนนเศรษฐกิจ ๑ หมู่ที่ ๖ ตำบลคลองมะเดื่อ อำเภอกระทุ่มแบน จังหวัดสมุทรสาคร สังกัดคณะสงฆ์มหานิกาย ที่ดินตั้งวัดมีเนื้อที่ ๒๗ ไร่ ๓ งาน อาณาเขตทั้งสี่ทิศ จดทุ่งนา อาคารเสนาสนะ ประกอบด้วย อุโบสถ กว้าง ๒๑.๖๐ เมตร ยาว ๓๕.๖๐ เมตร สร้างเมื่อ พ.ศ.๒๕๒๙ เป็นอาคารคอนกรีตเสริมเหล็ก กุฏิสงฆ์ จำนวน ๑๐ หลัง เป็นอาคารคอนกรีตเสริมเหล็ก ศาลาอเนกประสงค์ กว้าง ๑๕ เมตร ยาว ๒๗ เมตร สร้างเมื่อ พ.ศ.๒๕๒๕ เป็นอาคารคอนกรีตเสริมเหล็ก ศาลาบำเพ็ญกุศล จำนวน ๑ หลัง สร้างด้วยคอนกรีตเสริมเหล็ก

ปูชนียวัตถุมี พระประธานประจำอุโบสถ ปางมารวิชัย ขนาดหน้าตักกว้าง ๖๙ นิ้ว สูง ๖๙ นิ้ว ศิลปะสุโขทัย

วัดคลองมะเดื่อ ตั้งเมื่อวันที่ ๑๗ พฤษภาคม พ.ศ. ๒๕๒๒ เดิมเป็นทุ่งนาของเอกชนเจ้าอาวาสรูปปัจจุบัน และประชาชนใกล้เคียงช่วยกันบริจาคทุนทรัพย์ ซื้อที่นา ๒ แปลงและสร้างอาคารเสนาสนะ และพัฒนามาจนถึงปัจจุบัน ได้รับพระราชทานวิสุงคามสีมา เมื่อวันที่ ๒๗ พฤษภาคม พ.ศ. ๒๕๒๖ เขตวิสุงคามสีมากว้าง ๘ เมตร ยาว ๒๒ เมตร การบริหารและการปกครอง มีเจ้าอาวาสเท่าที่ทราบนาม คือ พระครูสาครธีรธรรม พ.ศ.๒๕๑๙ – ปัจจุบัน การศึกษา มีโรงเรียนพระปริยัติธรรมแผนกธรรม เปิดสอนเมื่อ พ.ศ.๒๕๒๐