สำนักสงฆ์บ่อน้ำร้อน ได้ก่อตั้งขึ้นเมื่อปีพ.ศ 2535 ได้ก่อสร้างสำนักสงฆ์โดยกำลังสรัทธาของประชาชน สำนักสงฆ์บ่อน้ำร้อน ตั้งอยู่ ณ บ้านบ่อน้ำร้อน หมู่ที่ 2 ตำบลตาเนาะแมเราะ อำเภอเบตง จังหวัดยะลา ปัจจุบันมีพระสงฆ์จำวัดอยู่ 5 รูป และมี พระสง่า ฐิตธรรมโม รักษาการหัวหน้าสงฆ์ เมื่อวันที่ 25 ธันวาคม พ.ศ 2555 สำนักพระพุทธศาสนาแห่งชาติได้ประกาศตั้งเป็นวัดขึ้นในพระพุทธศาสนามีนามว่า “ วัดบ่อน้ำร้อน “ สังกัดคณะสงฆ์มหานิกาย