เรือมะเขือยำ เป็นเรือสำคัญทางประวัติศาสตร์ เป็นเรือยาวมีอายุกว่าร้อยปี ทำด้วยไม้ตะเคียนที่ลอยน้ำมา ได้มีผู้พยายามนำขึ้นบก เพื่อนำไปถวายหลวงพ่อเพชรและหลวงพ่อกระจ่าง แต่ไม่สามารถกระทำได้ จึงมีผู้ทำการ เซ่นไหว้ ด้วยมะเขือยำ จึงนำเรือขึ้นบกได้ในที่สุด และได้ชื่อว่า เรือมะเขือยำ ตั้งแต่นั้นมา ลักษณะของเรือมะเขือยำ เป็นเรือยาวใช้ในการแข่งขัน ชนิด ๒๘ ฝีพาย เมื่อคราว พระบาทสมเด็จพระจุลจอมเกล้าเจ้าอยู่หัวเสด็จประพาสหลังสวน เมื่อวันที่ ๙ สิงหาคม ร.ศ.๑๐๘ (พ.ศ. ๒๔๓๒) เรือนี้เป็นเรือนำเสด็จ เรือกลไฟพระที่นั่งทอนิครอปต์ จากปากอ่าวไทยไปตามลำน้ำหลังสวนและเสด็จประทับพลับพลาตำบลบางขันเงิน นอกจากนี้ยังเคยใช้เป็นเรือแข่งในงานประเพณีแข่งเรือ ช่วงแรม ๑ ค่ำ เดือน ๑๑ จึงถือว่าเรือมะเขือยำเป็นเรือเกียรติยศที่มีความสำคัญต่อประวั๖ศาสตร์เมืองหลังสวน
ปัจจุบันเรือมะเขือยำ มิได้ใช้แข่งขัน แต่เป็นเรือเกียรติยศที่ใช้นำหน้าขบวนแห่ทางน้ำในพิธีเปิด งานแห่พระแข่งเรือ ขึ้นโขนชิงธง ของทุกปี