บ่อน้ำศักดิ์สิทธิ์ วัดมุจลินทวาปีวิหาร นับว่าเป็นบ่อน้ำที่สำคัญซึ่งใช้ในพิธีที่สำคัญของพระเจ้าแผ่นดิน ในการตักน้ำและเสกน้ำศักดิ์สิทธิ์ในปัจจุบัน ตามคำบอกเล่าว่าพระยาวิเชียรภักดีศรีสงคราม เจ้าเมืองหนองจิก ได้สร้างไว้เพื่อนำน้ำไปประกอบพิธีถือน้ำพิพัฒน์สัตยา เจ้าเมืองหนองจิกได้นำทหาร ตำรวจมาสาบานตน โดยตักน้ำในบ่อมาดื่ม บ่อน้ำนี้ใช้ในพระราชพิธีถือน้ำพิพัฒน์สัตยา เป็นพระราชพิธีที่แสดงถึงความจงรักภักดีต่อชาติ ศาสนา และพระมหากษัตริย์

ปัจจุบันทางวัดมุจลินทวาปีวิหาร ได้สร้างวิหารยอดปกคลุม อาคารคอนกรีตเสริมเหล็ก หลังคายอดแหลมแปดเหลี่ยม ตัวอาคารกว้าง ๓.๕๐ เมตร สูง ๑๒ เมตร รั้วรอบ ๘ เหลี่ยม กว้าง ๗.๕๐ เมตร ตั้งเด่นเป็นสง่าอยู่ บริเวณหน้าวัด

สำหรับบ่อน้ำศักดิ์สิทธิ์นี้ได้มีพิธีตักน้ำและเสกน้ำพระพุทธมนต์ เพื่อเป็นน้ำสรงถวายพระบาทสมเด็จพระเจ้าอยู่หัว เนื่องในโอกาสพระราชพิธีมหามงคลเฉลิมพระชนมพรรษา ๘๐ พรรษา พ.ศ. ๒๕๕๐ และเนื่องในโอกาสพระราชพิธีมหามงคลเฉลิมพระชนมพรรษา ๗ รอบ ๕ ธันวาคม พ.ศ. ๒๕๕๔