บ้านหนองโดนใต้ ตั้งขึ้นราวปี พ.ศ. ๒๕๐๐ เดิมรวมอยู่กับบ้านหนองโดน หมู่ ๓
ตำบลหนองคล้า อำเภอเมือง จังหวัดกำแพงเพชร ประชากรส่วนใหญ่ย้ายถิ่นฐานมาจากภาคตะวันออกเฉียงเหนือ เช่น จังหวัดนครราชสีมา จังหวัดขอนแก่น จังหวัดมหาสารคาม เป็นต้น ส่วนใหญ่มีอาชีพทำนา ทำไร่ ความเป็นอยู่ค่อนข้างยากจน แต่มีการพัฒนาหมู่บ้านมาเป็นลำดับ

ในปี พ.ศ. ๒๕๔๐ ประชากรมีจำนวนมากขึ้นทำให้การพัฒนาไม่ทั่วถึง จึงได้มีการขอแยกหมู่บ้านจากหมู่ที่ ๓ บ้านหนองโดน แยกเป็นบ้านหนองโดนใต้ หมู่ ๙ ตำบลพานทอง อำเภอไทรงาม จังหวัดกำแพงเพชร ขณะนั้นยังไม่มีการเลือกตั้งผู้ใหญ่บ้าน ประชาชนยังเห็นสมควรให้ นายสำราญ เทพคุณ ผู้ช่วยผู้ใหญ่บ้านเดิมมาเป็นผู้ใหญ่ และได้พัฒนาหมู่บ้านมาอย่างต่อเนื่อง จนถึงวันที่ ๑๕ ตุลาคม พ.ศ. ๒๕๔๖ ได้มีการเลือกตั้งผู้ใหญ่บ้านครั้งแรก ผู้ได้รับคัดเลือก คือ นายอุดม นักพรานบุญ