เทศบาลตำบลนครเนื่องเขตได้รับการยกฐานะจากสุขาภิบาลเป็นเทศบาลตำบล ตามพระราชบัญญัติการเปลี่ยนแปลงฐานะของสุขาภิบาลเป็นเทศบาล พ.ศ. ๒๕๔๒ ประกาศในพระราชกิจจานุเบกษา ฉบับฎีกา เล่มที่

๑๑๖ ตอนที่ ๙ ก. วันที่ ๒๔ กุมภาพันธ์ ๒๕๔๒ โดยมีผลบังคับใช้ตั้งแต่วันที่ ๒๕ พฤษภาคม ๒๕๔๒

เทศบาลตำบลนครเนื่องเขต เป็นเทศบาลขนาดเล็ก มีพื้นที่การปกครองประมาณ ๑.๕ ตารางกิโลเมตร ตั้งอยู่ในตำบลคลองนครเนื่องเขต ครอบคลุมพื้นที่บางส่วนของหมู่ ๖, ๗, ๘, ๙, ๑๐, ๑๑, ๑๒, ๑๓ และ ๑๔ มีจำนวนประชากรประมาณ ทั้งสิ้น ๑,๕๙๒ คน มี ศาลเจ้าในพื้นที่ จำนวน ๒ แห่ง

เทศบาลตำบลนครเนื่องเขต เป็นเครือข่ายทางวัฒนธรรม ที่สนับสนุนการดำเนินงานด้านวัฒนธรรมของท้องถิ่น ทั้งด้านงบประมาณ บุคลากร วัสดุ /อุปกรณ์ โดยได้สนับสนุน บริหารจัดการ ปรับภูมิทัศน์ และฟื้นฟูตลาดโบราณนครเนื่องเขต ให้มีวิถีชีวิตรูปแบบดั้งเดิมของชุมชนในอดีต ส่งเสริมให้เป็นสถานที่ท่องเที่ยวเชิงวัฒนธรรม และได้ปรับภูมิทัศน์ คลองนครเนื่องเขต ซึ่งเป็นคลองที่สำคัญของจังหวัดฉะเชิงเทรา เป็นคลองที่เกี่ยวเนื่องกับประวัติศาสตร์ ให้คงสภาพวิถีชีวิตแบบดั้งเดิม และส่งเสริมให้ชุมชนริมคลองนครเนื่องเขตอนุรักษ์วิถีชีวิตแบบดั้งเดิมไว้ นอกจากนี้ ยังจัดกิจกรรมด้านศาสนาและวัฒนธรรมประเพณี ณ ตลาดโบราณนครเนื่องเขต เป็นประจำต่อเนื่องทุกปี ได้แก่ ประเพณีหล่อเทียนและถวายเทียนพรรษา ประเพณีลอยกระทง ประเพณีสงกรานต์ มีการจัดกิจกรรมต่าง ๆ เนื่อง ในวันสำคัญของชาติ เช่นวันพ่อแห่งชาติ วันแม่แห่งชาติ นอกจากนี้ยังสนับสนุนงานของสภาวัฒนธรรมอำเภอเมืองฉะเชิงเทราด้วยดีเสมอมา

เทศบาลตำบลนครเนื่องเขต ได้รับการคัดเลือกจากกระทรวงวัฒนธรรมให้เป็นองค์กรปกครองส่วนท้องถิ่นดีเด่นในการการดำเนินงานจัดกิจกรรมทางวัฒนธรรม ด้านปรับภูมิทัศน์ชุมชน ประจำปี ๒๕๕๔ และ ประจำปี ๒๕๕๕

ปัจจุบัน มีนายเลอสรร สายวาณิชย์ ดำรงตำแหน่งนายกเทศมนตรีตำบลนครเนื่องเขต