เจดีย์วัดอโยธยาตั้งอยู่ภายในวัดอโยธยาทางด้านทิศตะวันตก หมู่ที่ 5 ตำบลหันตรา อำเภอพระนครศรีอยุธยา จังหวัดพระนครศรีอยุธยา

เจดีย์ประธานของวัดอโยธยานี้มีลักษณะเป็นเจดีย์ทรงระฆังกลมหรือทรงลังกาแปดเหลี่ยมตั้งอยู่บนฐานสี่เหลี่ยม รูประฆังเรียวปากแคบไม่ผายกว้าง องค์ระฆังกลมทำเป็นรูปปูนปั้นกลีบดอกบัวลดหลั่นแปลกตากว่าเจดีย์องค์อื่นๆ และมีบันไดขึ้นทางด้านหน้าและด้านหลัง นับว่าเป็นเจดีย์ที่มีวิวัฒนาการสืบช่วงมาจากเจดีย์อโยธยารุ่นแรก ซึ่งมีอายุกว่า 500 ปี

เมื่อปลายปี พ.ศ.2554 โบราณสถานในจังหวัดพระนครศรีอยุธยา ประสบอุทกภัยหลายแห่งทั้งในเขตอุทยานประวัติศาสตร์ นอกเกาะเมือง โบราณสถานกลุ่มอโยธยา และเจดีย์วัดอโยธยาองค์นี้ก็ได้รับความเสียหายจากถูกน้ำขังเป็นเวลานานหลายเดือนตั้งแต่บริเวณรอบฐานรากจนถึงองค์เจดีย์

สำนักศิลปากรที่ ๓ พระนครศรีอยุธยา ได้ทำการบูรณะและปรับปรุงภูมิทัศน์ตามโครงการบูรณะและปรับปรุงสภาพแวดล้อมโบราณสถานเจดีย์วัดอโยธยา

โดย...วัฒนธรรมอำเภอพระนครศรีอยุธยา

สำนักงานวัฒนธรรมจังหวัดพระนครศรีอยุธยา