โรงเรียนปทุมธานี “นันทมุนีบำรุง”ตั้งอยู่เลขที่ ๕๔ หมู่ ๒ ตำบลบางหลวง อำเภอเมืองปทุมธานี จังหวัดปทุมธานี เดิมเป็นโรงเรียนประจำอำเภอบางกระดี จังหวัดปทุมธานี มณฑลอยุธยา เปิดสอนถึงชั้น ม.๓ (ป.๗) ต่อมาวันที่ ๑๙ มีนาคม ๒๔๗๖ พระครูนันทมุนี (รามัญมุนี) ย้ายโรงเรียนมาสร้างที่วัดบางหลวงนอก และขยายการศึกษาขึ้นมาเป็นลำดับ โดยในปี พ.ศ.๒๔๙๙ โรงเรียนได้เปิดถึงระดับ ม.๖ (ม.ศ.๓) เนื่องจากขณะนั้น มีพื้นที่เพียง ๖ ไร่ ๒ งาน ไม่สามารถขยายพื้นที่ดำเนินการออกไปได้ โรงเรียนจึงไม่ก้าวหน้าเท่าที่ควร ต่อมา นายมงคล ธูปกระจ่าง อดีตครูใหญ่ ได้มีความพยายามที่จะขอเช่าที่ดินบริเวณศาลเจ้าพ่อป่าสะแก เพื่อปลูกสิ่งก่อสร้าง และย้ายโรงเรียนมาตั้งดำเนินการตั้งแต่ปี พ.ศ.๒๕๐๗ เป็นต้นมา จนถึงปี พ.ศ.๒๕๑๗ ได้เช่าที่ดินศาลเจ้าพ่อป่าสะแก ๒ ผืน คือบริเวณโรงเรียน ๑๕ ไร่ ๕๗ ตารางวา ก่อสร้างอาคารเรียน และที่ดินตรงข้ามโรงเรียน ขนาด ๑๓ ไร่ ๓ งาน ๘๖ ตารางวา สร้างขึ้นเป็นสนามกีฬา โดย ฯพณฯ ม.ร.ว.คืกฤทธิ์ ปราโมช นายกรัฐมนตรี ได้มาเป็นประธานในพิธีวางศิลาฤกษ์อาคารเรียน ๒๑๖ ก เมื่อวันที่ ๒ ตุลาคม ๒๕๑๘

พ.ศ.๒๕๒๑ โรงเรียนได้เปิดสอนหลักสูตรมัธยมศึกษาตอนต้น คือ ม.๑ – ม.๓ และต่อมาในปี พ.ศ.๒๕๓๕ ได้รับอนุมัติให้เปิดสอนระดับมัธยมศึกษาตอนปลาย ม.๔ – ม.๖ ดังนั้น ปัจจุบันโรงเรียนปทุมธานี “นันทมุนีบำรุง” จึงเปิดสอนตั้งแต่ระดับชั้น ม.๑ – ม.๖ มีห้องเรียน ๒๘ ห้องเรียน มีอาคารเรียน ๓ หลัง โรงฝึกงานอุตสาหกรรม คหกรรม ๒ หลัง อาคารชั่วคราวใช้ฝึกอาชีพอิสระ และใช้เรียน ๑ หลัง อาคารหอประชุม โรงอาหารขนาดใหญ่ ๑ หลัง ห้องพิพิธภัณฑ์ซึ่งรวบรวมวัตถุทางศิลปวัฒนธรรมล้ำค่าของจังหวัดปทุมธานี สวนพุทธศาสน์ ซึ่งเป็นสถานที่ฝึกปฏิบัติธรรมของนักเรียน สวนสุขภาพซึ่งประกอบด้วยอุปกรณ์สำหรับ ออกกำลังกาย จำนวน ๗ ฐาน สนามตะกร้อ สนามบาสเกตบอล สนามฟุตบอล

นอกจากนี้ โรงเรียนปทุมธานี “นันทมุนีบำรุง” ยังเป็นศูนย์วัฒนธรรมอำเภอเมืองปทุมธานี และเป็นโรงเรียนของชุมชน จึงได้รับความอุปถัมภ์บำรุงจากชุมชน และผู้มีจิตศรัทธาก้าวหน้าขึ้นเป็นลำดับ