โรงเรียนสันติวิทยาเดิมชื่อ โรงเรียนบ้านกูแย ตั้งอยู่ที่ หมู่ที่ ๕ ตำบลสะเอะ อ.กรงปินัง จ.ยะลา ๙๕๐๐๐ ก่อนจะที่เปลี่ยนมาเป็น โรงเรียนสันติวิทยา ตำบลสะเอะ อำเภอกรงปินัง จังหวัดยะลา เปิดสอนครั้งแรกเมื่อวันที่ ๑ พฤษภาคม ๒๕๐๖ ณ ที่บ้านพักคนงานของนายประมุข เลขะกุล ผู้เริ่มก่อดังมีดังต่อไปนี้ คือนายประพาส เรืองกาญจน์ กำนันตำบลสะเอะ, นายเจ๊ะและ ยูโซ๊ะ ผู้ใหญ่บ้านหมู่ที่๒ ตำบลสะเอะ และผู้ปกครองเด็กนักเรียนรวมทั้งชาวบ้านในหมู่บ้าน ปี พ.ศ. ๒๕๐๙ กำนันตำบลสะเอะได้ขอที่ดินจากนายประมุข เลขะกุล จำนวน ๔ ไร่ และได้ก่อสร้างอาคารเรียนขึ้น โดยด้รับงบประมาณจากกรมการปกครอง จำนวน ๗๕,๐๐๐ บาท เปิดทำการสอนเมื่อวันที่ ๑๗ พฤษภาคม ๒๕๑๑ ปี พ.ศ. ๒๕๒๓ ขบวนการโจรก่อการร้ายได้ลอบเผาโรงเรียนไหม้หมดทั้งหลัง ทำให้เอกสารทางราชการได้สูญเสียทั้งหมด ทางราชการได้จัดสรรงบประมาณให้ก่อสร้างอาคารเรียนแบบ ป.๑ก ห้องเรียนจำนวน ๑ หลัง งบประมาณ ๔๕๐,๐๐๐ บาท ปี พ.ศ. ๒๕๒๗สำนักงานคณะกรรมการการประถมศึกษาแห่งชาติ ได้จัดสรรงบประมาณสร้างอาคารเอนกประสงค์ สปช.๒๐๑/๒ต จำนวน ๑ หลัง และห้องส้วม แบบสปช.๖๐๑/๒ต ขนาด ๔ ที่นั่ง จำนวน ๑ หลัง ปี พ.ศ. ๒๕๒๘ โรงเรียนได้เข้าร่วมโครงการวัฒกรรมร่วม มีชาวต่างประเทศมาเยี่ยมโรงเรียนหลายคณะ เช่น ชาวออสเตรีย เกาหลี อินเดีย มาเลเซียฯ ปีพ.ศ. ๒๕๒๘ ได้จัดสรรอาคารเรียนแบบป.๑ ๒ ห้องเรียนจำนวน ๑ หลัง ปี พ.ศ. ๒๕๓๕ โรงเรียนได้รับจัดสรรงบประมาณ สร้างอาคารเรียนแบบสปช. ๑๐๕/๒๙ จำนวน ๔ ห้องเรียน ปีพ.ศ. มีคำสั่งสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษายะลา เขต ๑ ให้นางฉวีวรรณ จุณโท ผู้อำนวยการโรงเรียนสันติวิทยา ไปดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนท่าสาป อำเภอเมือง จังหวัดยะลา ปี พ.ศ. ๒๕๔๙ นายพลวัฒน์ บุญช่วย ผู้อำนวยการโรงเรียนคีรีบูรวฒนา (ตีบุ) อำเภอรามัน จังหวัดยะลา มาดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนสันติวิทยา เมื่อวันที่ ๓ กรกฏาคม ๒๕๔๙ ปี พ.ศ. ๒๕๔๙ มีคำสั่งแต่งตั้ง นางสุวรรณี หมัดอาด้ำ ครูโรงเรียนบ้านเบอร์เซ็ง อำเภอเมือง จังหวัดยะลา เป็นรองผู้อำนวยการโรงเรียนสันติวิทยา และปัจจุบันนี้ ผู้อำนวยการโรงเรียนสันติวิทยา ชื่อนาย สุรศักดิ์ สาและ
สีประจำโรงเรียนชมพู ,ขาว
ดอกไม้สัญลักณ์ประจำโรงเรียนดอกจามจุรี
คำขวัญโรงเรียนปฏิรูการเรียนรู้สู่มาตรฐาน ประสานความร่วมมือสู่ชุมชน พัฒนาคนสู่งานด้าน
อาชีพ และมีเนื้อที่ ๔ ไร่ ๑ งาน ๕๘ ตารางวา ( ทะเบียนที่ราชพสดุ เลขที่ ๓๐๙)
สถานที่ตั้งหมู่ที่ ๕ ตำบลสะเอะ อ.กรงปินัง จ.ยะลา ๙๕๐๐๐