สำนักปฏิบัติธรรมนิโรธาราม เนื่องจากได้มีญาติโยมจำนวนมากได้เข้ามาปรารภ กับท่าน

แม่ชีนันทญาณี (รุ้งเดือน สุวรรณ) ถึงสภาพปัญหาของสังคมว่า ในปัจจุบันมีคนที่มีความทุกข์ทางใจในการดำเนินชีวิตมากขึ้น และก็ได้ขอร้องให้แม่ชีนันทญาณีพร้อมด้วยคณะแม่ชี ๕ รูป ผู้ที่ได้ศึกษาและปฏิบัติตามพระธรรมคำสอนของพระพุทธเจ้า เป็นเวลาสิบกว่าปี ให้ช่วยนำพระธรรมคำสอนของพระผู้มีพระภาคเจ้ามาช่วยแนะนำพร้อมทั้งเผยแพร่พร่ำสอนให้ชาวบ้านได้มีหลักธรรมในการดำเนินชีวิต ให้เกิดประโยชน์และความสุขแก่ทั้งครอบครัวตนเองและบุคคลอื่น ซึ่ง ก็ได้มีญาติโยมและผู้มีจิตศรัทธาหลายท่าน ได้ร่วมกันซื้อที่ดินถวาย ให้กับท่านแม่ชีนันทญาณีพร้อมคณะแม่ชี เปิดเป็นสำนักปฏิบัติธรรมสำหรับผู้หญิง เมื่อวันที่ ๒๙ มกราคม ๒๕๓๘ รวมทั้งสิ้น

๑๙ ไร่ และได้รับความเมตตาจากพระภาวนาวิสุทธาจารย์ (หลวงพ่อทองใบ วัดอภิญญาเทสิตธรรม) ตั้งชื่อให้ว่า "สำนักปฏิบัติธรรมนิโรธาราม" ซึ่งมีความหมาย ว่า "อารามแห่งความดับทุกข์"
วัตถุประสงค์หลักของการก่อตั้งสำนักฯ มี ๒ ประการ คือ
๑) เพื่ออนุเคราะห์แก่สตรีที่ตั้งใจมาดำเนินชีวิตบนวิถีแห่งศีล สมาธิ ปัญญาตามรอยพระพุทธเจ้า
โดยมีท่านแม่ชีนันทญาณี เป็นผู้อบรมสั่งสอนตามพระพุทธพจน์
๒) เพื่อรองรับผู้ปฏิบัติธรรมจากหน่วยงานราชการ เอกชน และผู้สนใจใฝ่ธรรมทั่วไป ที่ได้ติดต่อขอเข้ารับการ

อบรมธรรมะจากท่านแม่ชีนันทญาณี ทั้งในรูปแบบค่ายอบรมและเข้ามาปฏิบัติเป็นการส่วนตัว
สำนักปฏิบัติธรรมนิโรธาราม อ.จอมทอง จ.เชียงใหม่ และ สำนักปฏิบัติธรรมสุทธจิตต์(นิโรธาราม ๒)

อ.ดอยสะเก็ด จ.เชียงใหม่ อยู่ภายใต้การสนับสนุนของมูลนิธินิโรธาราม โดยมีท่านภิกษุณีนันทญาณี เป็นประธานมูลนิธิ และ เป็นผู้อบรมสั่งสอนปกครองนักบวชทั้ง ๒ สำนัก
ปัจจุบันสำนักปฏิบัติธรรมนิโรธาราม มีสามเณรีจำนวน ๑๐ รูป แม่ชีจำนวน ๒ ท่าน อุบาสิกาประจำจำนวน ๒ ท่าน เป็นสถานที่รองรับให้ผู้หญิงได้เข้ามาศึกษาพระพุทธศาสนาตามแนวทางพระไตรปิฎก และใช้เป็นสถานที่ในการอบรมค่ายคุณธรรม จริยธรรม โดยมีหน่วยงานทั้งภาครัฐบาลและเอกชน รวมถึงสถาบันการศึกษาต่างๆ เช่น มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ มหาวิทยาลัยนเรศวร จังหวัดพิษณุโลก การไฟฟ้าฝ่ายผลิตแห่งประเทศไทย (กฟผ.) เป็นต้น มาขอจัดค่ายคุณธรรม จริยธรรม ตั้งแต่ปี พ.ศ. ๒๕๓๘ จนถึงปัจจุบัน