โรงเรียนเซกา ตั้งอยู่เลขที่ ๒๐๕ หมู่ ๗ ต.เซกา อ.เซกา จังหวัดบึงกาฬ บนพื้นที่ ๑๗ ไร่ ๒ งานได้รับอนุญาตให้เปิดทำการสอนเมื่อวันที่ ๘ กรกฎาคม ๒๕๑๒ มีนักเรียนชั้นมัธยมศึกษาปีที่ ๑ เข้าเรียนวันแรก จำนวน ๘ คน และมีนักเรียนทยอยเข้าเรียนเมื่อสิ้นภาคเรียนที่ ๑ ปีการศึกษา ๒๕๑๒ รวม ๓๐ คน โดยอาศัยครูและอาคารเรียนโรงเรียนบ้านเซกาเป็นสถานที่จัดการเรียนชั่วคราว ต่อมาในปีการศึกษา ๒๕๑๓ กรมสามัญศึกษาได้แต่งตั้ง นายสุเมธี โพธิ์ศรี ให้ดำรงตำแหน่งครูใหญ่คนแรก

คติพจน์ : อตฺตานํ ทมยนฺติ บณฺฑิตา "ผู้มีปัญญาย่อมฝึกฝนตน"

คำขวัญ : เรียนดี มีวินัย ใฝ่คุณธรรม

วิสัยทัศน์ : สร้างคนดี มีปัญญา พัฒนาสังคม

ปัจจุบัน โรงเรียนเซกา เปิดสอนในระดับมัธยมศึกษาตอนตันจนถึงตอนปลาย สังกัดสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษามัธยมศึกษา อเขต ๒๑ โดยมี นายคอมฉันท์ นาเมืองรักษ์ ดำรงตำแหน่ง ผู้อำนวยการโรงเรียนเซกา